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转录组数据分析与科研项目设计

转录组的一般研究方法

转录组-01.导论

转录组-02.从转录组中获取mRNA的表达量

转录组-03.从转录组中获取mRNA的位置和结构

转录组-04.从转录组测序数据中获取DNA水平的差异

转录组-05.从转录组中研究非编码RNA的功能

转录组的未来发展方向

01.转录组的多组学研究——转录组 基因组

02.转录组的多组学研究——转录组 表观组

03.转录组的多组学研究——转录组 翻译组

04.转录组的多组学研究——转录组 蛋白组

非编码转录组的科研项目设计

01.非编码RNA常见的生物学功能

02.非编码RNA的功能验证思路

03.非编码RNA分析数据库及工具推荐

编码转录组的数据分析

01.测序数据过滤和质控

02.有参转录组序列比对

03.基因表达定量

04.差异表达分析

05.差异基因功能富集分析

非编码转录组的数据分析

01.lnRNA-序列比对与转录本拼接

02.非编码转录本去冗余-cuffcompare

03.lnRNA的鉴定-CPC2

04.lnRNA与mRNA的共表达分析

05.lnRNA与miRNA互作分析

06.转录组结果可视化-IGV的使用

转录组案例解析

01.拟南芥空间单细胞转录组案例

02.丹参酮转录组研究案例

03.PALM-seq探索新冠患者血浆游离RNA的分子特征