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如何利用NIPT数据进行孕期表型和疾病的关联研究

认证背景


    随着无创产前基因检测(NIPT)在临床的广泛应用,全球已积累了数量庞大的孕妇NIPT全基因组测序数据。这些数据覆盖人群广、样本规模大,蕴含了丰富的遗传变异信息。2024年10月,华大联合武汉儿童医院等10家顶尖机构,通过深入研究NIPT数据,在Cell Genomics期刊以封面专辑形式发表6篇重磅论文,首次系统解析了孕期生化表型组、母子代谢互作及妊娠期糖尿病的遗传机制,展现了NIPT数据的潜在科研价值。

    华大教育中心特邀请内部专家,面向有科研需求的工作者,开发了一套系统、实用的数据分析在线课程,分享基因型填补(Genotype Imputation)、全基因组关联分析(GWAS)等数据分析方法,帮助科研人员解决NIPT超低测序深度数据分析的问题,为研究复杂孕期表型和疾病机制打开新的思路。



课程亮点



你将获得哪些核心能力?

  • 从0到1,掌握NIPT数据分析完整流程:从预处理到变异检测、从基因型填补到GWAS,手把手带你深入实践
  • 熟练使用数据分析关键工具与平台:实战讲解BaseVAR、STITCH、GLIMPSE、PLINK、LDSC等关键工具
  • 独立开展NIPT科研项目的实战能力:不仅能进行GWAS分析,遗传力估计、富集分析等post-GWAS也不在话下
  • 科研项目落地方案有保障:无论你已有数据未充分利用,计划迭代课题方案,还是准备布局新项目,都能助你事半功倍


课程信息

  • 课时安排:共6学时



适合人群
  • 临床科研人员:已有NIPT数据但需补充深度分析经验

  • 生物信息分析师:计划扩展低深度WGS数据在群体遗传学中的应用



课程目录

  • 导论 在开始研究前,我们需要为NIPT大数据分析做好哪些准备?
  • 第一节 分析流程:NIPT数据标准分析流程关键步骤
  • 第二节 工具使用:主流缺失填补工具的使用和选择
  • 第三节 数据准备:复杂孕期表型和疾病数据的清洗和标准化
  • 第四节 关联分析:NIPT数据与孕期表型和疾病的关联分析
  • 第五节 数据解读:解读遗传变异与孕期表型和疾病的相关性
  • 第六节 文章准备:变异的生物学意义及深入解析