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课程简介

自从RNA被发现在基因组和蛋白组之间作为关键的调控和中间媒介后，转录本的鉴定和基因表达定量就成为分子生物学中的研究热点，而利用高通量RNA测序，能够很好地帮助人们进行这两项研究。


然而近年来越来越多的方法学和分析流程的被公开发表与应用，让很多初学者感到迷茫与困惑，尤其是如何理解RNA－Seq研究的必要和关键步骤。由于研究目的千差万别，目前没有一个分析流程能够适用于所有的项目。


本次专题分为Section 1和Section 2，将会带大家回顾RNA－Seq数据分析中的主要步骤，包括实验设计，数据质控，数据比对，基因和转录本定量，数据可视化，基因差异表达，可变剪接，功能分析，融合基因检测和eQTL检测等等。同时，我们将会针对每一步分析中的难点与挑战，一起探讨新技术可能带来的转录组研究的革新。


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课程大纲

01/ 转录组组装

转录组组装与基因组组装有哪些不同？

转录组组装主要有哪些方法和软件？

如何评估组装的结果？


02/ 可变剪接

为什么要关注可变剪接？

可变剪接有哪些分析方法？


03/ 单碱基多态性（SNP）

用全基因组重测序或外显子测序，和用RNA－Seq数据找SNP有什么区别？

SNP在转录组中有什么特有的应用？


04/基因融合

基因融合是如何产生的？

为什么癌症研究中大家尤其关注融合基因的鉴定？



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课程对象

01/ 如果你有临床/生物/基因组方向或者其他相关专业背景，希望通过高通量测序回答生物学问题


02/ 或者你正准备开始转录组数据的生物信息分析，却不知道如何入手；

又或者你对转录组分析内容感兴趣的话...


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讲师介绍

袁永娴

袁永娴,华大RNA方向研发负责人，主要研究方向为基因表达定量，可变剪接与融合基因的鉴定，长链非编码RNA的预测与功能分析，新平台与新技术在RNA方向的应用。


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