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生物信息数据统计和绘图技能

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庞大的测序数据到常规数据处理,从剥丝抽茧的统计分析到精确生动的图形绘制方法,R语言是生物信息数据分析、统计和绘图最强大的工具之一。该课程详细介绍R语言的基本语法,常用数据处理命令以及绘图方法。

授课计划: 课程共分5个部分:

1、R语言简介

  • 1.1 R语言的历史、定义、功能及现状
  • 1.2 R语言的优势
  • 1.3 R语言的帮助系统
  • 1.4R的安装与运行
  • 2、R语言语法以及主要数据结构

  • 2.1 R语法、对象及属性
  • 2.2 R常用运算符
  • 2.3 R语言数据结构及类型
  • 2.4 R数据结构——向量建立
  • 2.5 R数据结构——向量运算
  • 2.6 R数据结构——数组
  • 2.7 R数据结构——数据框
  • 2.8 R数据结构——列表、因子
  • 2.9 R程序设计
  • 3、数据的读取与存储

  • 3.1数据浏览与编辑
  • 3.2数据读取与存储
  • 4、基础绘图工具

  • 4.1绘图函数简介、高级绘图参数
  • 4.2常用绘图参数
  • 4.3画图面板分割及图形保存
  • 5、图形案例

  • 5.1散点图1
  • 5.2散点图2
  • 5.3散点图3
  • 5.4条形图
  • 5.5文氏图
  • 5.6饼图
  • 5.7盒形图&频率直方图
  • 5.8热图
  • 5.9 PCA得分图、3D图、多组图、火山图、树状图、圈图
  • 教师

    Course Staff Image #1

    闻博

    深圳市华大基因学院生物信息绘图技能培训首席讲师;从事生物信息分析工作多年,授课经验丰富,责任心强,讲解细致,举一反三。主要研究方向及擅长领域:蛋白质组学、转录组学、基因组学、小RNA。

    学员前期准备:
  • 《R语言实战》书籍阅读
  • 学习网站:http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN/other-docs.html

  • 相关学习资源
  • 《R语言实战》 《R Graphics Cookbook 》 《R for Beginners》

  • 您可加入以下QQ群,与大家交流讨论,共同学习:

    华大基因遗传咨询认证 347068035

    华大基因生物信息认证 338195958


    以上课程信息会持续更新,敬请关注!

    1. 课程代码

      BIO001_01
    2. 课程开始

      2015/07/02
    3. 价格

      ¥1199
    选修